L'obiettivo di questo programma è quello di monitorare la qualità delle acque superficiali dei fiumi Agri, Basento, Bradano, Sinni, Cavone, Noce e Ofanto, secondo quanto previsto dal D.G.R. n°7852/96. La rete di monitoraggio predisposta dalla Regione Basilicata, in attuazione del Decreto Legislativo 130/1992, è costituita da 20 stazioni SINA'88. A partire dal 2006 si esegue anche il monitoraggio del torrente Sauro. Il fiume Agri viene monitorato a monte della diga del Pertusillo, al confine tra il Comune di Grumento Nova (PZ) e di Montemurro (PZ), e a valle dell'invaso, nel Comune di Sant'Arcangelo, nei pressi della confluenza con il torrente Sauro.

Figura 4 - Punti di monitoraggio delle acque superficiali (immagine satellitare tratta da Google Earth).

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 _{* Programma Operativo Regionale P.O.R. Basilicata 2000 – 2006. Allegato 1. Documento di valutazione ex ante ambientale. Potenza, Giugno 2004.}